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| Die AG Kolb befindet sich am Institut für Pharmazeutische Chemie der Philipps-Universität Marburg. |  |
| Wir sind des Weiteren Mitglied in SYNMIKRO |  |
| und DRUID. |  |
| Die AG war stark an COST Action CM1207 "GLISTEN: GPCR-Ligand Interactions, Structures, and Transmembrane Signalling: a European Research Network" beteiligt |   |
| und Teil von SynChemBio. |  |
| Die Arbeitsgruppe entstand durch die großzügige Förderung der DFG im Emmy Noether Programm. |  |
| [en][de] |
Word cloud wurde mit WordClouds.com aus Publikationszusammenfassungen erzeugt. Dank an Xavier Deupi für die Idee! |
Kleine Moleküle werden häufig sowohl von der Natur als auch therapeutisch eingesetzt, um die Aktivität des Proteins an welches sie binden zu modulieren. Trotzdem werden viele Aspekte von Molekül:Protein Interaktionen überraschend schlecht verstanden. Polypharmakologie, d.h. das Binden eines Liganden an mehrere Proteine, tritt oftmals überraschend auf, obwohl diese Eigenschaft der eigentliche Grund für Wirksamkeit oder Nebenwirkungen eines Wirkstoffes sein kann. Auf der Seite der Proteine kann eine Punktmutation in der Bindetasche, was an sich nur eine kleine Veränderung darstellt, die Bindung eines Wirkstoffes verunmöglichen und damit Resistenzen bewirken. Es ist daher von grossem Interesse ein umfassendes Verständnis der Molekül:Protein Interaktionsprofile in molekularem Detail zu erhalten und diese Profile mit Signal- und Metabolismuspfaden zu korrelieren. Docking von kleinen Molekülen ist unsere Hauptmethode, aber wir forschen auch in den angrenzenden Gebieten der Chemoinformatik und Molekulardynamik. Die Untersuchungen richten sich hauptsächlich auf Kinasen und G-Protein-gekoppelte Rezeptoren (GPCRs). |
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Identification and in silico structural analysis of Gallus gallus Protein Arginine Methyltransferase 4 (PRMT4) FEBS Open Bio 2017, accepted. [pdf] |
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An open source pharma roadmap PLOS Med 2017, 14, e1002276. [pdf][essay] |
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Similarity- and substructure-based development of β2-adrenergic receptor ligands based on unusual scaffolds ACS Med. Chem. Lett. 2017, 8, 481-485. [pdf] |
| Florent Chevillard | [Postdoc] | |
| Matthäus Drabek | [Doktorand] | |
| Anja Flöser | [Doktorandin] | |
| Peter Kolb | [Gruppenleiter] | |
| Maria Martí-Solano | [Postdoc] | |
| Ricarda Nagel | [Studentische Hilfskraft] | |
| Julius Perschel | [Studentische Hilfskraft] | |
| Magdalena Scharf | [Doktorandin] | |
| Corey Taylor | [Doktorand] | |
| Niek van Hilten | [ehemaliger Master Student] | |
| Nicht auf dem Bild: | ||
| Lydia Hartleben | [Assistentin] | |
| Stefania Monteleone | [Postdoc] | |
| Maria Giovanna Papadopoulos | [Masterandin] | |
| Susanne Roth | [Gastwissenschafterin] | |
Wir entwickeln und betreuen DAIM (Decomposition And Identification of Molecules), ein Programm zur Generierung von Molekülfragmenten im Kontext von fragment-basiertem Docking und der Analyse von Moleküldatenbanken. Für weitere Informationen und potentielle andere Anwendungen von DAIM lesen Sie bitte die Bedienungsanleitung oder Publikation [4]. Wir sind auch immer froh über Fehlermeldungen, wollen jedoch anregen vorher diese Anleitung von Simon Tatham zu lesen.
Am 7. September 2009 wurde DAIM 5.3 veröffentlicht. Diese Aktualisierung enthält einige Verbesserungen und unterstützt mehr anwenderspezifische Einstellungen in Bezug auf die zu schneidenden Bindungen. Kurz gesagt ist es nun möglich, alle Grundeinstellungen zu umgehen. Das Programm kann auf dieser Seite heruntergeladen werden.