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Kolb Lab Heisenberg DFG

Netzwerke

Die AG Kolb befindet sich am Institut für Pharmazeutische Chemie der Philipps-Universität Marburg.

Wir sind des Weiteren Mitglied in SYNMIKRO,
im SFB/Transregio 81 (TRR81),
und DRUID.
Wir sind auch Teil des Netzwerks ERNEST, dem "European Research Network on Signal Transduction".



Die AG war stark an COST Action CM1207 "GLISTEN: GPCR-Ligand Interactions, Structures, and Transmembrane Signalling: a European Research Network" beteiligt
und Teil von SynChemBio.
Die Arbeitsgruppe entstand durch die großzügige Förderung der DFG im Emmy Noether Programm. Emmy Noether DFG
[en][de]


Forschung

Docking
Word cloud wurde mit WordClouds.com aus Publikationszusammenfassungen erzeugt. Dank an Xavier Deupi für die Idee!

Kleine Moleküle werden häufig sowohl von der Natur als auch therapeutisch eingesetzt, um die Aktivität des Proteins an welches sie binden zu modulieren. Trotzdem werden viele Aspekte von Molekül:Protein Interaktionen überraschend schlecht verstanden. Polypharmakologie, d.h. das Binden eines Liganden an mehrere Proteine, tritt oftmals überraschend auf, obwohl diese Eigenschaft der eigentliche Grund für Wirksamkeit oder Nebenwirkungen eines Wirkstoffes sein kann. Auf der Seite der Proteine kann eine Punktmutation in der Bindetasche, was an sich nur eine kleine Veränderung darstellt, die Bindung eines Wirkstoffes verunmöglichen und damit Resistenzen bewirken. Es ist daher von grossem Interesse ein umfassendes Verständnis der Molekül:Protein Interaktionsprofile in molekularem Detail zu erhalten und diese Profile mit Signal- und Metabolismuspfaden zu korrelieren.

Docking von kleinen Molekülen ist unsere Hauptmethode, aber wir forschen auch in den angrenzenden Gebieten der Chemoinformatik und Molekulardynamik. Die Untersuchungen richten sich hauptsächlich auf Kinasen und G-Protein-gekoppelte Rezeptoren (GPCRs).


Publikationen

Zuletzt veröffentlicht:
41 Interrogating dense ligand chemical space with a forward-synthetic library.
Florent Chevillard, Silvia Stotani, Anna Karawajczyk, Stanimira Hristeva, Els Pardon, Jan Steyaert, Dimitrios Tzalis*, Peter Kolb*
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2019, 116, 11496-11501. [pdf]
40 Direct targeting of Gαq and Gα11 oncoproteins in cancer cells.
Suvi Annala, Xiaodong Feng, Naveen Shridhar, Funda Eryilmaz, Julian Patt, JuHee Yang, Eva M. Pfeil, Rodolfo Daniel Cervantes-Villagrana, Asuka Inoue, Felix Häberlein, Tanja Slodczyk, Raphael Reher, Stefan Kehraus, Stefania Monteleone, Ramona Schrage, Nina Heycke, Ulrike Rick, Sandra Engel, Alexander Pfeifer, Peter Kolb, Gabriele König, Moritz Bünemann, Thomas Tüting, José Vázquez-Prado, J. Silvio Gutkind, Evelyn Gaffal, Evi Kostenis
Sci. Signal. 2019, 12, eaau5948. [pdf]
39 Virtual Compound Libraries in Computer-Assisted Drug Discovery.
Niek van Hilten, Florent Chevillard, Peter Kolb
J. Chem. Inf. Model. 2019, 59, 644-651. [pdf][perspective]
vollständige Liste

Mitarbeiterinnen & Mitarbeiter

Matthäus Drabek [Doktorand]
Anja Flöser [Doktorandin]
Leen Ghanem [ehemalige Studentische Hilfskraft]
Torben Gutermuth [ehemalige Studentische Hilfskraft]
Peter Kolb [Gruppenleiter]
Stefania Monteleone [Postdoc]
Magdalena Scharf [Doktorandin]
Corey Taylor [Doktorand]
Nicht auf dem Bild:
Viviane Corrêa Santos [Gastwissenschaftlerin]
Lydia Hartleben [Assistentin]
Janik Hedderich [Masterand]
Jonas Kammertöns [PJ Student]
Victor Lim [Doktorand]
Lea Löffler [Studentische Hilfskraft]
Maria Giovanna Papadopoulos [Doktorandin]
Margherita Persechino [Masterandin]
Naiá Porã Santos [Praktikantin]
Susanne Roth [Gastwissenschaftlerin]
Johanna Senst [Doktorandin]

Lehre

Wir lehren in den Vorlesungen und Praktika der Pharmazeutischen Chemie. Des Weiteren nehmen wir Wahlpflichtpraktikantinnen und Wahlpflichtpraktikanten aus der Chemie und Pharmazie auf. Studierende mit einem starken Interesse an Computerberechnungen, Chemie und Biochemie, sowie deren Anwendung auf pharmazeutische Fragestellungen werden für B.Sc.-, M.Sc.- und Doktorarbeiten angenommen.

Scubidoo & Pingui


PrenDB


Daim – ein Programm zur Erzeugung von Molekülfragmenten


In der AG mitarbeiten




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